Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acta2P62737 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Acta2P62737 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acta2P62737 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acta2P62737 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acta2P62737 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms