Protein–RNA interactions for Protein: P61588

Rnd3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnd3P61588 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnd3P61588 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms