Protein–RNA interactions for Protein: P60824

Cirbp, Cold-inducible RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CirbpP60824 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CirbpP60824 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CirbpP60824 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CirbpP60824 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CirbpP60824 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CirbpP60824 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CirbpP60824 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CirbpP60824 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CirbpP60824 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CirbpP60824 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CirbpP60824 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CirbpP60824 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CirbpP60824 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CirbpP60824 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CirbpP60824 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CirbpP60824 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CirbpP60824 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CirbpP60824 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CirbpP60824 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CirbpP60824 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CirbpP60824 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CirbpP60824 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CirbpP60824 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CirbpP60824 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CirbpP60824 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CirbpP60824 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CirbpP60824 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CirbpP60824 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CirbpP60824 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CirbpP60824 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CirbpP60824 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CirbpP60824 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CirbpP60824 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms