Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P58686 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P58686 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P58686 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P58686 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P58686 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P58686 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P58686 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P58686 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P58686 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P58686 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P58686 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P58686 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P58686 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P58686 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P58686 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P58686 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P58686 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P58686 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P58686 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P58686 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
P58686 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P58686 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P58686 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P58686 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P58686 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P58686 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P58686 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P58686 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P58686 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P58686 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P58686 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P58686 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P58686 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P58686 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P58686 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P58686 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P58686 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P58686 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P58686 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P58686 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P58686 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P58686 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P58686 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P58686 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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P58686 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P58686 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P58686 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P58686 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P58686 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P58686 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P58686 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P58686 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P58686 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P58686 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P58686 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P58686 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P58686 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P58686 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P58686 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P58686 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P58686 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P58686 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P58686 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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P58686 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P58686 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P58686 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P58686 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P58686 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P58686 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P58686 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P58686 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P58686 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P58686 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P58686 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P58686 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P58686 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P58686 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P58686 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P58686 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P58686 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P58686 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P58686 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P58686 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P58686 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P58686 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P58686 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P58686 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P58686 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P58686 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P58686 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P58686 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P58686 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P58686 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P58686 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P58686 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P58686 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P58686 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms