Protein–RNA interactions for Protein: P57791

Rce1, CAAX prenyl protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rce1P57791 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rce1P57791 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rce1P57791 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rce1P57791 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rce1P57791 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rce1P57791 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rce1P57791 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rce1P57791 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rce1P57791 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rce1P57791 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rce1P57791 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rce1P57791 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rce1P57791 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rce1P57791 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rce1P57791 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rce1P57791 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rce1P57791 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rce1P57791 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rce1P57791 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rce1P57791 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rce1P57791 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rce1P57791 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rce1P57791 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rce1P57791 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rce1P57791 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rce1P57791 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rce1P57791 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rce1P57791 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rce1P57791 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rce1P57791 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rce1P57791 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rce1P57791 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rce1P57791 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rce1P57791 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rce1P57791 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rce1P57791 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rce1P57791 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rce1P57791 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rce1P57791 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rce1P57791 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rce1P57791 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rce1P57791 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rce1P57791 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rce1P57791 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rce1P57791 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rce1P57791 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rce1P57791 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms