Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bace1P56818 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bace1P56818 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Bace1P56818 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Bace1P56818 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Bace1P56818 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bace1P56818 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bace1P56818 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bace1P56818 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bace1P56818 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms