Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GferP56213 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GferP56213 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GferP56213 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GferP56213 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GferP56213 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GferP56213 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GferP56213 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GferP56213 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GferP56213 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GferP56213 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GferP56213 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GferP56213 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GferP56213 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GferP56213 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GferP56213 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GferP56213 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GferP56213 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GferP56213 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GferP56213 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GferP56213 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GferP56213 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GferP56213 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GferP56213 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GferP56213 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GferP56213 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GferP56213 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GferP56213 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GferP56213 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GferP56213 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GferP56213 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GferP56213 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GferP56213 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GferP56213 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GferP56213 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GferP56213 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GferP56213 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GferP56213 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GferP56213 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GferP56213 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GferP56213 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GferP56213 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GferP56213 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GferP56213 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GferP56213 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GferP56213 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GferP56213 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GferP56213 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GferP56213 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GferP56213 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GferP56213 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GferP56213 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GferP56213 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GferP56213 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GferP56213 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GferP56213 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GferP56213 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GferP56213 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GferP56213 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GferP56213 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
GferP56213 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GferP56213 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GferP56213 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GferP56213 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GferP56213 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GferP56213 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GferP56213 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GferP56213 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GferP56213 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GferP56213 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GferP56213 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GferP56213 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GferP56213 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GferP56213 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GferP56213 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GferP56213 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GferP56213 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GferP56213 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GferP56213 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GferP56213 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GferP56213 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GferP56213 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GferP56213 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GferP56213 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GferP56213 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GferP56213 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GferP56213 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GferP56213 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GferP56213 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GferP56213 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GferP56213 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GferP56213 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GferP56213 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GferP56213 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GferP56213 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GferP56213 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GferP56213 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GferP56213 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GferP56213 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GferP56213 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms