Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Rad23bP54728 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms