Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RabggtbP53612 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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