Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ApodP51910 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ApodP51910 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ApodP51910 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ApodP51910 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ApodP51910 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ApodP51910 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ApodP51910 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ApodP51910 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ApodP51910 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ApodP51910 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ApodP51910 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ApodP51910 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ApodP51910 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ApodP51910 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ApodP51910 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ApodP51910 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ApodP51910 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ApodP51910 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ApodP51910 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ApodP51910 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ApodP51910 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ApodP51910 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ApodP51910 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ApodP51910 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ApodP51910 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ApodP51910 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ApodP51910 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ApodP51910 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ApodP51910 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ApodP51910 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ApodP51910 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ApodP51910 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ApodP51910 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ApodP51910 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ApodP51910 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ApodP51910 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ApodP51910 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ApodP51910 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ApodP51910 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ApodP51910 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ApodP51910 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ApodP51910 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ApodP51910 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ApodP51910 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ApodP51910 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ApodP51910 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ApodP51910 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ApodP51910 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ApodP51910 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ApodP51910 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ApodP51910 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ApodP51910 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ApodP51910 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ApodP51910 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ApodP51910 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ApodP51910 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ApodP51910 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ApodP51910 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ApodP51910 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ApodP51910 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ApodP51910 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ApodP51910 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ApodP51910 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ApodP51910 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ApodP51910 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ApodP51910 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ApodP51910 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ApodP51910 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ApodP51910 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ApodP51910 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ApodP51910 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ApodP51910 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ApodP51910 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ApodP51910 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ApodP51910 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ApodP51910 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ApodP51910 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ApodP51910 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ApodP51910 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ApodP51910 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ApodP51910 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ApodP51910 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ApodP51910 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ApodP51910 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ApodP51910 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ApodP51910 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ApodP51910 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ApodP51910 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ApodP51910 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ApodP51910 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ApodP51910 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ApodP51910 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ApodP51910 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ApodP51910 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ApodP51910 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ApodP51910 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ApodP51910 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ApodP51910 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ApodP51910 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms