Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Opn1swP51491 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Opn1swP51491 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms