Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TspoP50637 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TspoP50637 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TspoP50637 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TspoP50637 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TspoP50637 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TspoP50637 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TspoP50637 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TspoP50637 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TspoP50637 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TspoP50637 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TspoP50637 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TspoP50637 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TspoP50637 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TspoP50637 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TspoP50637 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TspoP50637 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TspoP50637 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TspoP50637 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TspoP50637 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TspoP50637 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TspoP50637 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TspoP50637 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TspoP50637 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TspoP50637 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TspoP50637 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TspoP50637 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TspoP50637 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TspoP50637 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TspoP50637 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TspoP50637 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TspoP50637 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TspoP50637 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TspoP50637 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TspoP50637 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TspoP50637 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TspoP50637 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TspoP50637 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TspoP50637 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TspoP50637 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TspoP50637 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TspoP50637 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TspoP50637 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TspoP50637 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TspoP50637 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TspoP50637 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TspoP50637 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TspoP50637 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TspoP50637 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TspoP50637 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TspoP50637 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TspoP50637 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TspoP50637 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TspoP50637 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TspoP50637 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TspoP50637 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TspoP50637 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TspoP50637 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TspoP50637 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TspoP50637 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TspoP50637 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TspoP50637 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TspoP50637 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TspoP50637 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TspoP50637 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TspoP50637 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TspoP50637 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TspoP50637 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TspoP50637 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TspoP50637 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TspoP50637 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TspoP50637 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TspoP50637 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TspoP50637 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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TspoP50637 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TspoP50637 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TspoP50637 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TspoP50637 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TspoP50637 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TspoP50637 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TspoP50637 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TspoP50637 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TspoP50637 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TspoP50637 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TspoP50637 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TspoP50637 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TspoP50637 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TspoP50637 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TspoP50637 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TspoP50637 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TspoP50637 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TspoP50637 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TspoP50637 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TspoP50637 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TspoP50637 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TspoP50637 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TspoP50637 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TspoP50637 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TspoP50637 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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