Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cxcl5P50228 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms