Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ercc3P49135 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms