Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prox1P48437 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prox1P48437 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prox1P48437 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prox1P48437 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prox1P48437 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prox1P48437 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prox1P48437 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prox1P48437 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prox1P48437 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prox1P48437 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prox1P48437 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prox1P48437 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prox1P48437 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Prox1P48437 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prox1P48437 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms