Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gli1P47806 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gli1P47806 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gli1P47806 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gli1P47806 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gli1P47806 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gli1P47806 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gli1P47806 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gli1P47806 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms