Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nedd4P46935 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nedd4P46935 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nedd4P46935 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms