Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ItgavP43406 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ItgavP43406 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ItgavP43406 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ItgavP43406 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ItgavP43406 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ItgavP43406 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ItgavP43406 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ItgavP43406 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ItgavP43406 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ItgavP43406 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ItgavP43406 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ItgavP43406 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms