Protein–RNA interactions for Protein: P43024

Cox6a1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6a1P43024 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox6a1P43024 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox6a1P43024 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox6a1P43024 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox6a1P43024 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox6a1P43024 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox6a1P43024 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox6a1P43024 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox6a1P43024 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox6a1P43024 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox6a1P43024 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox6a1P43024 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox6a1P43024 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox6a1P43024 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox6a1P43024 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox6a1P43024 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox6a1P43024 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox6a1P43024 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox6a1P43024 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox6a1P43024 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox6a1P43024 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox6a1P43024 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox6a1P43024 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox6a1P43024 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox6a1P43024 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox6a1P43024 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox6a1P43024 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox6a1P43024 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox6a1P43024 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox6a1P43024 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox6a1P43024 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox6a1P43024 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox6a1P43024 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox6a1P43024 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox6a1P43024 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox6a1P43024 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox6a1P43024 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox6a1P43024 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox6a1P43024 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox6a1P43024 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox6a1P43024 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cox6a1P43024 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cox6a1P43024 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cox6a1P43024 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cox6a1P43024 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms