Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Chd1P40201 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Chd1P40201 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Chd1P40201 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Chd1P40201 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Chd1P40201 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Chd1P40201 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Chd1P40201 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Chd1P40201 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Chd1P40201 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Chd1P40201 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Chd1P40201 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Chd1P40201 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Chd1P40201 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Chd1P40201 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Chd1P40201 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Chd1P40201 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Chd1P40201 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Chd1P40201 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Chd1P40201 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Chd1P40201 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Chd1P40201 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Chd1P40201 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Chd1P40201 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Chd1P40201 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Chd1P40201 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Chd1P40201 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Chd1P40201 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Chd1P40201 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Chd1P40201 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Chd1P40201 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Chd1P40201 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Chd1P40201 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Chd1P40201 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Chd1P40201 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Chd1P40201 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Chd1P40201 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Chd1P40201 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Chd1P40201 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Chd1P40201 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Chd1P40201 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Chd1P40201 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Chd1P40201 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Chd1P40201 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Chd1P40201 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Chd1P40201 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Chd1P40201 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Chd1P40201 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Chd1P40201 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Chd1P40201 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
Chd1P40201 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Chd1P40201 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Chd1P40201 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Chd1P40201 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Chd1P40201 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Chd1P40201 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Chd1P40201 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Chd1P40201 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Chd1P40201 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Chd1P40201 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Chd1P40201 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Chd1P40201 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Chd1P40201 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Chd1P40201 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Chd1P40201 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Chd1P40201 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Chd1P40201 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Chd1P40201 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Chd1P40201 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Chd1P40201 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Chd1P40201 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Chd1P40201 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Chd1P40201 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Chd1P40201 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Chd1P40201 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Chd1P40201 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Chd1P40201 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Chd1P40201 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Chd1P40201 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Chd1P40201 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Chd1P40201 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Chd1P40201 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Chd1P40201 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Chd1P40201 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Chd1P40201 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Chd1P40201 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Chd1P40201 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Chd1P40201 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms