Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sar1aP36536 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sar1aP36536 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sar1aP36536 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sar1aP36536 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sar1aP36536 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sar1aP36536 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sar1aP36536 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sar1aP36536 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sar1aP36536 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sar1aP36536 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sar1aP36536 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sar1aP36536 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sar1aP36536 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sar1aP36536 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sar1aP36536 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Sar1aP36536 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sar1aP36536 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sar1aP36536 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sar1aP36536 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sar1aP36536 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sar1aP36536 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sar1aP36536 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms