Protein–RNA interactions for Protein: P35460

Ly6f, Lymphocyte antigen 6F, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6fP35460 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ly6fP35460 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ly6fP35460 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms