Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sftpa1P35242 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sftpa1P35242 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms