Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptpn11P35235 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptpn11P35235 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptpn11P35235 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptpn11P35235 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptpn11P35235 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptpn11P35235 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptpn11P35235 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ptpn11P35235 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ptpn11P35235 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ptpn11P35235 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ptpn11P35235 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ptpn11P35235 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ptpn11P35235 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ptpn11P35235 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ptpn11P35235 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ptpn11P35235 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ptpn11P35235 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ptpn11P35235 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ptpn11P35235 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ptpn11P35235 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ptpn11P35235 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ptpn11P35235 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms