Protein–RNA interactions for Protein: P31695

Notch4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,964 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch4P31695 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Notch4P31695 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Notch4P31695 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Notch4P31695 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Notch4P31695 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Notch4P31695 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Notch4P31695 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Notch4P31695 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Notch4P31695 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Notch4P31695 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Notch4P31695 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Notch4P31695 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Notch4P31695 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Notch4P31695 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms