Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
U2af2P26369 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
U2af2P26369 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
U2af2P26369 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U2af2P26369 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2af2P26369 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2af2P26369 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2af2P26369 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
U2af2P26369 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
U2af2P26369 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
U2af2P26369 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
U2af2P26369 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms