Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cd247P24161 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd247P24161 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd247P24161 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd247P24161 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd247P24161 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd247P24161 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd247P24161 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd247P24161 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd247P24161 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd247P24161 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd247P24161 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd247P24161 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd247P24161 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd247P24161 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd247P24161 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd247P24161 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd247P24161 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd247P24161 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd247P24161 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd247P24161 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd247P24161 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd247P24161 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd247P24161 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd247P24161 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd247P24161 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd247P24161 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd247P24161 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cd247P24161 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cd247P24161 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms