Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ms4a2P20490 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ms4a2P20490 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms