Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rps6ka1P18653 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rps6ka1P18653 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms