Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gata1P17679 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gata1P17679 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gata1P17679 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gata1P17679 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gata1P17679 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gata1P17679 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gata1P17679 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gata1P17679 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gata1P17679 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gata1P17679 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gata1P17679 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gata1P17679 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gata1P17679 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gata1P17679 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gata1P17679 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gata1P17679 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gata1P17679 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gata1P17679 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gata1P17679 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gata1P17679 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gata1P17679 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gata1P17679 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gata1P17679 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gata1P17679 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gata1P17679 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gata1P17679 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gata1P17679 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gata1P17679 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gata1P17679 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gata1P17679 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gata1P17679 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gata1P17679 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gata1P17679 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gata1P17679 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gata1P17679 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gata1P17679 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gata1P17679 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gata1P17679 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gata1P17679 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gata1P17679 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms