Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl2P10148 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms