Protein–RNA interactions for Protein: P09092

Hoxa6, Homeobox protein Hox-A6, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa6P09092 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa6P09092 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa6P09092 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa6P09092 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa6P09092 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa6P09092 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa6P09092 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa6P09092 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxa6P09092 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxa6P09092 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxa6P09092 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxa6P09092 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa6P09092 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms