Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NefmP08553 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NefmP08553 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NefmP08553 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NefmP08553 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NefmP08553 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NefmP08553 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NefmP08553 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NefmP08553 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NefmP08553 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NefmP08553 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NefmP08553 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NefmP08553 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NefmP08553 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NefmP08553 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NefmP08553 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NefmP08553 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NefmP08553 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NefmP08553 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NefmP08553 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NefmP08553 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NefmP08553 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NefmP08553 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NefmP08553 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NefmP08553 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NefmP08553 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NefmP08553 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NefmP08553 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NefmP08553 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NefmP08553 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NefmP08553 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NefmP08553 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NefmP08553 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NefmP08553 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NefmP08553 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NefmP08553 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NefmP08553 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NefmP08553 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NefmP08553 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NefmP08553 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NefmP08553 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NefmP08553 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NefmP08553 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NefmP08553 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NefmP08553 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NefmP08553 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NefmP08553 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NefmP08553 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NefmP08553 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NefmP08553 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NefmP08553 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NefmP08553 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NefmP08553 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NefmP08553 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NefmP08553 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NefmP08553 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NefmP08553 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NefmP08553 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NefmP08553 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NefmP08553 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NefmP08553 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NefmP08553 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NefmP08553 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NefmP08553 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NefmP08553 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NefmP08553 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NefmP08553 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NefmP08553 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NefmP08553 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NefmP08553 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NefmP08553 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NefmP08553 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NefmP08553 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NefmP08553 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NefmP08553 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NefmP08553 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NefmP08553 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NefmP08553 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NefmP08553 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NefmP08553 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NefmP08553 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NefmP08553 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NefmP08553 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NefmP08553 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NefmP08553 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NefmP08553 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NefmP08553 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NefmP08553 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NefmP08553 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NefmP08553 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NefmP08553 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NefmP08553 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NefmP08553 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NefmP08553 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NefmP08553 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NefmP08553 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NefmP08553 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NefmP08553 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NefmP08553 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NefmP08553 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms