Protein–RNA interactions for Protein: P04184

Tk1, Thymidine kinase, cytosolic, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk1P04184 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tk1P04184 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tk1P04184 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tk1P04184 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tk1P04184 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tk1P04184 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tk1P04184 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tk1P04184 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tk1P04184 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tk1P04184 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tk1P04184 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tk1P04184 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tk1P04184 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tk1P04184 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tk1P04184 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tk1P04184 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tk1P04184 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tk1P04184 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tk1P04184 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tk1P04184 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tk1P04184 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tk1P04184 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tk1P04184 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tk1P04184 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tk1P04184 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tk1P04184 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tk1P04184 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tk1P04184 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tk1P04184 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms