Protein–RNA interactions for Protein: P01915

H-2 class II histocompatibility antigen, E-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01915 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01915 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01915 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01915 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01915 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01915 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01915 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01915 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01915 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01915 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01915 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01915 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01915 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01915 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01915 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01915 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01915 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01915 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01915 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01915 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01915 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01915 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01915 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01915 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01915 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01915 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01915 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01915 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01915 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01915 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01915 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01915 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01915 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01915 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01915 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01915 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01915 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01915 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01915 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01915 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01915 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01915 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01915 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
P01915 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01915 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01915 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01915 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01915 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01915 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01915 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01915 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01915 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01915 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01915 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01915 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01915 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01915 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01915 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01915 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01915 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01915 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01915 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01915 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01915 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01915 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01915 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01915 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01915 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01915 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01915 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01915 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01915 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01915 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01915 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
P01915 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01915 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01915 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01915 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01915 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01915 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01915 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01915 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01915 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01915 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01915 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01915 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
P01915 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01915 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01915 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01915 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01915 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01915 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
P01915 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01915 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01915 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01915 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
P01915 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01915 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01915 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01915 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms