Protein–RNA interactions for Protein: P01660

Ig kappa chain V-III region PC 3741/TEPC 111, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01660 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01660 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01660 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01660 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01660 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01660 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01660 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01660 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01660 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01660 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01660 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01660 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01660 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01660 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01660 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01660 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01660 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01660 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01660 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01660 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01660 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01660 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01660 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01660 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01660 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01660 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01660 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01660 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01660 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01660 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01660 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01660 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01660 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01660 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01660 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01660 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01660 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01660 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01660 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01660 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01660 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01660 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01660 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01660 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01660 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01660 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01660 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01660 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01660 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01660 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01660 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01660 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01660 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01660 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01660 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01660 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01660 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01660 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01660 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01660 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01660 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01660 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P01660 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01660 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01660 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P01660 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01660 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01660 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01660 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01660 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01660 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01660 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01660 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01660 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01660 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01660 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01660 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01660 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01660 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01660 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01660 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01660 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01660 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01660 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01660 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01660 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01660 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01660 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01660 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01660 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01660 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01660 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01660 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01660 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01660 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01660 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01660 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01660 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01660 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01660 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms