Protein–RNA interactions for Protein: P01658

Ig kappa chain V-III region MOPC 321, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01658 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01658 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01658 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01658 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01658 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01658 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01658 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01658 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01658 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01658 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01658 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01658 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01658 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01658 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01658 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01658 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01658 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01658 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01658 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01658 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01658 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01658 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01658 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01658 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01658 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01658 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01658 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01658 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01658 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01658 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01658 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01658 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01658 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01658 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01658 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01658 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01658 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01658 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01658 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01658 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01658 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01658 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01658 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01658 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01658 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01658 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01658 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01658 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01658 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01658 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01658 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01658 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01658 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01658 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01658 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01658 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01658 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01658 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01658 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01658 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01658 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01658 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01658 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01658 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01658 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01658 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01658 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01658 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01658 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01658 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01658 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01658 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01658 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01658 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01658 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01658 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01658 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01658 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01658 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01658 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01658 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01658 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01658 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01658 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01658 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01658 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01658 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01658 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01658 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01658 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01658 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01658 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01658 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01658 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01658 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01658 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01658 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01658 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01658 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01658 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms