Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mtatp6P00848 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms