Protein–RNA interactions for Protein: O89112

Lancl1, LanC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl1O89112 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lancl1O89112 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lancl1O89112 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lancl1O89112 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lancl1O89112 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lancl1O89112 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lancl1O89112 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lancl1O89112 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lancl1O89112 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lancl1O89112 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lancl1O89112 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lancl1O89112 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lancl1O89112 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lancl1O89112 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lancl1O89112 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lancl1O89112 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lancl1O89112 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lancl1O89112 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lancl1O89112 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lancl1O89112 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lancl1O89112 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lancl1O89112 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lancl1O89112 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lancl1O89112 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lancl1O89112 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lancl1O89112 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lancl1O89112 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lancl1O89112 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lancl1O89112 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lancl1O89112 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lancl1O89112 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lancl1O89112 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lancl1O89112 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lancl1O89112 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lancl1O89112 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lancl1O89112 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lancl1O89112 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lancl1O89112 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lancl1O89112 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lancl1O89112 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lancl1O89112 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lancl1O89112 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lancl1O89112 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lancl1O89112 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lancl1O89112 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lancl1O89112 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lancl1O89112 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lancl1O89112 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lancl1O89112 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Lancl1O89112 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Lancl1O89112 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Lancl1O89112 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lancl1O89112 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lancl1O89112 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lancl1O89112 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lancl1O89112 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lancl1O89112 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lancl1O89112 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lancl1O89112 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lancl1O89112 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lancl1O89112 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lancl1O89112 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lancl1O89112 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lancl1O89112 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lancl1O89112 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lancl1O89112 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lancl1O89112 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lancl1O89112 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lancl1O89112 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lancl1O89112 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lancl1O89112 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lancl1O89112 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lancl1O89112 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lancl1O89112 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lancl1O89112 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lancl1O89112 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lancl1O89112 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lancl1O89112 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lancl1O89112 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lancl1O89112 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lancl1O89112 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lancl1O89112 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lancl1O89112 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lancl1O89112 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lancl1O89112 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lancl1O89112 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lancl1O89112 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lancl1O89112 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lancl1O89112 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lancl1O89112 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lancl1O89112 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lancl1O89112 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lancl1O89112 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lancl1O89112 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lancl1O89112 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lancl1O89112 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lancl1O89112 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lancl1O89112 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lancl1O89112 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lancl1O89112 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms