Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

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Length 300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
F11rO88792 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
F11rO88792 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
F11rO88792 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
F11rO88792 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
F11rO88792 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
F11rO88792 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
F11rO88792 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
F11rO88792 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
F11rO88792 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
F11rO88792 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
F11rO88792 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
F11rO88792 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
F11rO88792 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
F11rO88792 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
F11rO88792 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
F11rO88792 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
F11rO88792 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
F11rO88792 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
F11rO88792 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
F11rO88792 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
F11rO88792 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
F11rO88792 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
F11rO88792 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
F11rO88792 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
F11rO88792 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
F11rO88792 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
F11rO88792 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
F11rO88792 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
F11rO88792 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
F11rO88792 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
F11rO88792 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
F11rO88792 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
F11rO88792 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
F11rO88792 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
F11rO88792 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
F11rO88792 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
F11rO88792 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
F11rO88792 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
F11rO88792 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
F11rO88792 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
F11rO88792 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
F11rO88792 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
F11rO88792 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
F11rO88792 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
F11rO88792 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
F11rO88792 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
F11rO88792 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
F11rO88792 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
F11rO88792 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
F11rO88792 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
F11rO88792 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
F11rO88792 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
F11rO88792 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
F11rO88792 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
F11rO88792 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
F11rO88792 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
F11rO88792 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
F11rO88792 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
F11rO88792 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
F11rO88792 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
F11rO88792 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
F11rO88792 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
F11rO88792 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
F11rO88792 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
F11rO88792 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
F11rO88792 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
F11rO88792 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
F11rO88792 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
F11rO88792 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
F11rO88792 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
F11rO88792 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
F11rO88792 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
F11rO88792 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
F11rO88792 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
F11rO88792 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
F11rO88792 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
F11rO88792 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
F11rO88792 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
F11rO88792 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
F11rO88792 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
F11rO88792 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
F11rO88792 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
F11rO88792 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
F11rO88792 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
F11rO88792 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
F11rO88792 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
F11rO88792 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
F11rO88792 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
F11rO88792 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
F11rO88792 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
F11rO88792 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F11rO88792 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
F11rO88792 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F11rO88792 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
F11rO88792 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
F11rO88792 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F11rO88792 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F11rO88792 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
F11rO88792 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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