Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AvilO88398 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AvilO88398 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AvilO88398 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AvilO88398 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AvilO88398 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AvilO88398 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AvilO88398 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AvilO88398 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AvilO88398 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AvilO88398 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AvilO88398 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AvilO88398 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AvilO88398 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AvilO88398 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AvilO88398 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AvilO88398 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AvilO88398 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AvilO88398 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AvilO88398 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AvilO88398 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AvilO88398 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AvilO88398 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AvilO88398 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AvilO88398 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AvilO88398 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AvilO88398 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AvilO88398 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AvilO88398 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AvilO88398 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AvilO88398 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AvilO88398 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AvilO88398 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
AvilO88398 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AvilO88398 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
AvilO88398 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AvilO88398 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AvilO88398 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AvilO88398 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AvilO88398 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AvilO88398 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AvilO88398 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AvilO88398 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AvilO88398 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AvilO88398 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AvilO88398 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AvilO88398 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AvilO88398 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AvilO88398 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AvilO88398 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AvilO88398 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AvilO88398 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AvilO88398 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AvilO88398 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
AvilO88398 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
AvilO88398 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AvilO88398 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AvilO88398 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AvilO88398 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AvilO88398 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AvilO88398 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AvilO88398 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
AvilO88398 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AvilO88398 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AvilO88398 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AvilO88398 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AvilO88398 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AvilO88398 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AvilO88398 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AvilO88398 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AvilO88398 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AvilO88398 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AvilO88398 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AvilO88398 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AvilO88398 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AvilO88398 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
AvilO88398 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
AvilO88398 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
AvilO88398 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AvilO88398 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AvilO88398 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AvilO88398 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AvilO88398 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
AvilO88398 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AvilO88398 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AvilO88398 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AvilO88398 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AvilO88398 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AvilO88398 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AvilO88398 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AvilO88398 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
AvilO88398 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AvilO88398 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AvilO88398 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AvilO88398 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AvilO88398 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AvilO88398 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AvilO88398 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AvilO88398 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AvilO88398 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms