Protein–RNA interactions for Protein: O55225

Otog, Otogelin, mousemouse

Predictions only

Length 2,910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtogO55225 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtogO55225 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OtogO55225 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OtogO55225 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OtogO55225 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OtogO55225 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OtogO55225 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OtogO55225 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OtogO55225 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OtogO55225 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OtogO55225 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OtogO55225 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OtogO55225 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
OtogO55225 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OtogO55225 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OtogO55225 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OtogO55225 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtogO55225 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtogO55225 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtogO55225 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtogO55225 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtogO55225 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtogO55225 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtogO55225 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtogO55225 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtogO55225 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtogO55225 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtogO55225 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtogO55225 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OtogO55225 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OtogO55225 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OtogO55225 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OtogO55225 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OtogO55225 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OtogO55225 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OtogO55225 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OtogO55225 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
OtogO55225 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
OtogO55225 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
OtogO55225 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
OtogO55225 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
OtogO55225 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtogO55225 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
OtogO55225 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtogO55225 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtogO55225 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtogO55225 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtogO55225 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtogO55225 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtogO55225 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtogO55225 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtogO55225 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtogO55225 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtogO55225 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtogO55225 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtogO55225 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtogO55225 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OtogO55225 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OtogO55225 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OtogO55225 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OtogO55225 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OtogO55225 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OtogO55225 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OtogO55225 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OtogO55225 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OtogO55225 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OtogO55225 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OtogO55225 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OtogO55225 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OtogO55225 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OtogO55225 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OtogO55225 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OtogO55225 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
OtogO55225 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OtogO55225 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OtogO55225 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OtogO55225 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OtogO55225 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OtogO55225 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OtogO55225 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OtogO55225 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OtogO55225 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OtogO55225 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtogO55225 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtogO55225 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtogO55225 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtogO55225 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtogO55225 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
OtogO55225 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtogO55225 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtogO55225 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtogO55225 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
OtogO55225 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtogO55225 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtogO55225 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtogO55225 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtogO55225 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtogO55225 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtogO55225 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtogO55225 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms