Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TsksO54887 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TsksO54887 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TsksO54887 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TsksO54887 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TsksO54887 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TsksO54887 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TsksO54887 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TsksO54887 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TsksO54887 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TsksO54887 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TsksO54887 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TsksO54887 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TsksO54887 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TsksO54887 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TsksO54887 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TsksO54887 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TsksO54887 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TsksO54887 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TsksO54887 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TsksO54887 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TsksO54887 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TsksO54887 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TsksO54887 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TsksO54887 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TsksO54887 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TsksO54887 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TsksO54887 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TsksO54887 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TsksO54887 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TsksO54887 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TsksO54887 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TsksO54887 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TsksO54887 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TsksO54887 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TsksO54887 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TsksO54887 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TsksO54887 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TsksO54887 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TsksO54887 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TsksO54887 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TsksO54887 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TsksO54887 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TsksO54887 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TsksO54887 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TsksO54887 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TsksO54887 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TsksO54887 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TsksO54887 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TsksO54887 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TsksO54887 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TsksO54887 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TsksO54887 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TsksO54887 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TsksO54887 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TsksO54887 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TsksO54887 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TsksO54887 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TsksO54887 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TsksO54887 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TsksO54887 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TsksO54887 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TsksO54887 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TsksO54887 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TsksO54887 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TsksO54887 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TsksO54887 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TsksO54887 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TsksO54887 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TsksO54887 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TsksO54887 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TsksO54887 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TsksO54887 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TsksO54887 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TsksO54887 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TsksO54887 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TsksO54887 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TsksO54887 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TsksO54887 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TsksO54887 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TsksO54887 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TsksO54887 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TsksO54887 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TsksO54887 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TsksO54887 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TsksO54887 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TsksO54887 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TsksO54887 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TsksO54887 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TsksO54887 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TsksO54887 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TsksO54887 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TsksO54887 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TsksO54887 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TsksO54887 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TsksO54887 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TsksO54887 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TsksO54887 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TsksO54887 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TsksO54887 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms