Protein–RNA interactions for Protein: O08919

Numbl, Numb-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NumblO08919 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NumblO08919 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NumblO08919 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NumblO08919 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NumblO08919 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NumblO08919 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NumblO08919 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NumblO08919 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NumblO08919 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NumblO08919 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NumblO08919 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NumblO08919 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NumblO08919 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NumblO08919 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NumblO08919 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NumblO08919 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NumblO08919 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NumblO08919 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NumblO08919 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NumblO08919 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NumblO08919 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NumblO08919 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NumblO08919 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NumblO08919 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NumblO08919 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NumblO08919 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NumblO08919 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NumblO08919 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NumblO08919 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NumblO08919 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NumblO08919 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NumblO08919 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NumblO08919 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NumblO08919 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NumblO08919 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NumblO08919 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NumblO08919 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NumblO08919 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NumblO08919 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NumblO08919 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NumblO08919 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NumblO08919 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NumblO08919 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NumblO08919 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NumblO08919 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NumblO08919 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NumblO08919 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NumblO08919 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NumblO08919 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NumblO08919 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NumblO08919 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NumblO08919 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NumblO08919 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NumblO08919 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NumblO08919 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NumblO08919 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NumblO08919 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NumblO08919 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NumblO08919 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NumblO08919 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NumblO08919 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NumblO08919 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NumblO08919 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NumblO08919 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NumblO08919 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NumblO08919 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NumblO08919 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NumblO08919 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NumblO08919 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NumblO08919 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NumblO08919 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NumblO08919 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NumblO08919 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NumblO08919 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NumblO08919 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NumblO08919 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NumblO08919 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NumblO08919 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NumblO08919 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NumblO08919 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NumblO08919 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NumblO08919 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NumblO08919 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NumblO08919 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NumblO08919 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NumblO08919 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NumblO08919 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NumblO08919 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NumblO08919 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NumblO08919 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NumblO08919 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NumblO08919 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NumblO08919 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NumblO08919 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NumblO08919 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NumblO08919 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
NumblO08919 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NumblO08919 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NumblO08919 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NumblO08919 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms