Protein–RNA interactions for Protein: O08788

Dctn1, Dynactin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn1O08788 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dctn1O08788 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dctn1O08788 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms