Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vwa3bJ9JI28 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vwa3bJ9JI28 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms