Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
J3QKU1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
J3QKU1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
J3QKU1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
J3QKU1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
J3QKU1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
J3QKU1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
J3QKU1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
J3QKU1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
J3QKU1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
J3QKU1 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
J3QKU1 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
J3QKU1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
J3QKU1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
J3QKU1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
J3QKU1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
J3QKU1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
J3QKU1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
J3QKU1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
J3QKU1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
J3QKU1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
J3QKU1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
J3QKU1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
J3QKU1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
J3QKU1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
J3QKU1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
J3QKU1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
J3QKU1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
J3QKU1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
J3QKU1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
J3QKU1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
J3QKU1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
J3QKU1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
J3QKU1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
J3QKU1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
J3QKU1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
J3QKU1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
J3QKU1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
J3QKU1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
J3QKU1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
J3QKU1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
J3QKU1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
J3QKU1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
J3QKU1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
J3QKU1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
J3QKU1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
J3QKU1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
J3QKU1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
J3QKU1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
J3QKU1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
J3QKU1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
J3QKU1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
J3QKU1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
J3QKU1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
J3QKU1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
J3QKU1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
J3QKU1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
J3QKU1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
J3QKU1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
J3QKU1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
J3QKU1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
J3QKU1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
J3QKU1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
J3QKU1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
J3QKU1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
J3QKU1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
J3QKU1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
J3QKU1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
J3QKU1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
J3QKU1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
J3QKU1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
J3QKU1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
J3QKU1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
J3QKU1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
J3QKU1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
J3QKU1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
J3QKU1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
J3QKU1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
J3QKU1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
J3QKU1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
J3QKU1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
J3QKU1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
J3QKU1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
J3QKU1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
J3QKU1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
J3QKU1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
J3QKU1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
J3QKU1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
J3QKU1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
J3QKU1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
J3QKU1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
J3QKU1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
J3QKU1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
J3QKU1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
J3QKU1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
J3QKU1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
J3QKU1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
J3QKU1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
J3QKU1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
J3QKU1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms