Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pot1bH7BX60 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms