Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nkx1-1G3UXB3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nkx1-1G3UXB3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms