Protein–RNA interactions for Protein: F8VQB8

Npcd, Neuronal pentraxin chromo domain, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpcdF8VQB8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms